Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syngap1F6SEU4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Syngap1F6SEU4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Syngap1F6SEU4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syngap1F6SEU4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 454.9 ms