Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn2r48E9Q5D8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn2r48E9Q5D8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn2r48E9Q5D8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms