Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pde8bE9Q4S1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pde8bE9Q4S1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde8bE9Q4S1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde8bE9Q4S1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms