Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ApobE9Q414 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ApobE9Q414 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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