Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Susd1E9Q3H4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Susd1E9Q3H4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Susd1E9Q3H4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Susd1E9Q3H4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms