Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
5430401F13RikE9Q328 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
5430401F13RikE9Q328 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
5430401F13RikE9Q328 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms