Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Wdr17E9Q271 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Wdr17E9Q271 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Wdr17E9Q271 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Wdr17E9Q271 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Wdr17E9Q271 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms