Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NebE9Q1W3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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