Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Fndc1E9Q043 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Fndc1E9Q043 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Fndc1E9Q043 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Fndc1E9Q043 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Fndc1E9Q043 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms