Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp4E9PYK3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Parp4E9PYK3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Parp4E9PYK3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms