Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srp54bE9PXC0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srp54bE9PXC0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srp54bE9PXC0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srp54bE9PXC0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms