Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3002E9PW72 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3002E9PW72 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3002E9PW72 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms