Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc144bE9PVZ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms