Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim30bE9PVL6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim30bE9PVL6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim30bE9PVL6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms