Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc175E9PVB3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc175E9PVB3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc175E9PVB3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc175E9PVB3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms