Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cngb1E1AZ71 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cngb1E1AZ71 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cngb1E1AZ71 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cngb1E1AZ71 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cngb1E1AZ71 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms