Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm28043E0CXC2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm28043E0CXC2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28043E0CXC2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms