Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tgfbr3lD3YZZ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms