Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smok3bC0HKC9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smok3bC0HKC9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smok3bC0HKC9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smok3bC0HKC9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smok3bC0HKC9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smok3bC0HKC9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smok3bC0HKC9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smok3bC0HKC9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smok3bC0HKC9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Smok3bC0HKC9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smok3bC0HKC9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms