Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zfc3h1B2RT41 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfc3h1B2RT41 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfc3h1B2RT41 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms