Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf3B2RQG2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf3B2RQG2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf3B2RQG2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms