Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU2

Plekhd1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plekhd1B2RPU2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plekhd1B2RPU2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Plekhd1B2RPU2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Plekhd1B2RPU2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plekhd1B2RPU2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms