Protein–RNA interactions for Protein: B1AW18

4930402K13Rik, MCG54973, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402K13RikB1AW18 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930402K13RikB1AW18 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930402K13RikB1AW18 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4930402K13RikB1AW18 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930402K13RikB1AW18 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930402K13RikB1AW18 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms