Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Phactr2B1AVP0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phactr2B1AVP0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phactr2B1AVP0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phactr2B1AVP0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms