Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slfn8B1ARD8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slfn8B1ARD8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slfn8B1ARD8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms