Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint8A7XV07 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint8A7XV07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Skint8A7XV07 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Skint8A7XV07 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms