Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930435E12RikA6X8Z9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.3 ms