Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5640A3KG49 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5640A3KG49 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm5640A3KG49 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms