Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ism1A2ATD1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ism1A2ATD1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ism1A2ATD1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms