Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GabreA2AMW3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GabreA2AMW3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GabreA2AMW3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GabreA2AMW3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms