Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FocadA2AKG8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FocadA2AKG8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FocadA2AKG8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FocadA2AKG8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FocadA2AKG8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms