Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ambra1A2AH22 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ambra1A2AH22 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ambra1A2AH22 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ambra1A2AH22 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ambra1A2AH22 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms