Protein–RNA interactions for Protein: A2AG10

Nup62cl, Nucleoporin 62 C-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62clA2AG10 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nup62clA2AG10 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nup62clA2AG10 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nup62clA2AG10 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup62clA2AG10 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup62clA2AG10 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup62clA2AG10 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nup62clA2AG10 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup62clA2AG10 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup62clA2AG10 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup62clA2AG10 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nup62clA2AG10 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms