Protein–RNA interactions for Protein: A2A9F4

Kdf1, Keratinocyte differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdf1A2A9F4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdf1A2A9F4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdf1A2A9F4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdf1A2A9F4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdf1A2A9F4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kdf1A2A9F4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdf1A2A9F4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms