Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprfA2A8L5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprfA2A8L5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprfA2A8L5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms