Protein–RNA interactions for Protein: A2A7F4

Rlf, MCG122876, mousemouse

Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RlfA2A7F4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RlfA2A7F4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RlfA2A7F4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RlfA2A7F4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RlfA2A7F4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms