Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Krtap1-3A2A588 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Krtap1-3A2A588 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms