Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pgap3A2A559 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pgap3A2A559 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pgap3A2A559 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms