Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Akap17bA2A3V1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Akap17bA2A3V1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Akap17bA2A3V1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms