Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc173A0JLY1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc173A0JLY1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc173A0JLY1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc173A0JLY1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms