Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trbv21A0A0A6YX06 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Trbv21A0A0A6YX06 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Trbv21A0A0A6YX06 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Trbv21A0A0A6YX06 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Trbv21A0A0A6YX06 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trbv21A0A0A6YX06 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Trbv21A0A0A6YX06 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Trbv21A0A0A6YX06 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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Trbv21A0A0A6YX06 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Trbv21A0A0A6YX06 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Trbv21A0A0A6YX06 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trbv21A0A0A6YX06 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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