Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28510A0A087WP28 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28510A0A087WP28 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28510A0A087WP28 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms