Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5L1

Igkv10-94, Immunoglobulin kappa variable 10-94 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv10-94A0A075B5L1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igkv10-94A0A075B5L1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igkv10-94A0A075B5L1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igkv10-94A0A075B5L1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Igkv10-94A0A075B5L1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms