Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv31A0A075B5J5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv31A0A075B5J5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trbv31A0A075B5J5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms