Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trbv4A0A075B5I2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trbv4A0A075B5I2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trbv4A0A075B5I2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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