Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrit3W8DXL4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms