Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm18492-201ENSMUST00000198141 1018 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3238W4VSP7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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