Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Knop1Q9Z2Q2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Knop1Q9Z2Q2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms