Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Robo3Q9Z2I4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms