Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn6Q9Z262 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Cldn6Q9Z262 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn6Q9Z262 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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